Warum hat die Ukraine so lange die Wahrheit verschwiegen und so getan als sei der Luftwaffenchef schuld?

Niemand hat etwas verschwiegen. Die Absturzursache war erstmal unbekannt.

"Aufgrund der Komplexität der Verteidigungsmission könnte es womöglich zu einem fatalen Fehler gekommen sein. [...] Laut einem möglichen Szenario, das aktuell in ukrainischen Kreisen kursieren soll, soll der F-16-Kampfjet versehentlich durch die Trümmerwolke einer russischen Rakete geflogen sein. Diese könnte zuvor durch den erfolgreichen Abschuss eines russischen Flugkörpers entstanden sein."

Und wenn die Piloten auf Missionen geschickt werden, bei denen sie überfordert worden sind, oder die zu gefährlich waren und etwas geht schief, dann ist eben auch der Luftwaffenchef dafür verantwortlich.

Die Fragestellung ist tendenziös und geht in die Richtung russischer Desinformation. Die Ukraine hat keine Warheit verschwiegen, sondern versucht, die Ursache des Absturzes zu ermitteln. Bis heute ist diese auch noch nicht abschließend geklärt, daher darf man sich doch wirklich fragen, was so eine Fragestellung soll, außer die Ukraine in ein negatives Licht zu stellen, das sich selbst aus dem zitierten Artikel überhaupt nicht ergibt. Bei einem verbrecherischen russischen Großangriff auf die Ukraine mit Drohnen und Raketen ist ein ukrainisches Flugzeug abgestürzt, das kann im Krieg immer passieren, jetzt wird man die Ursache ermitteln, damit man daraus lernt, wie man das künftig besser vermeidet.

Im Krieg fallen nun eben auch mal Kampfflugzeuge vom Himmel, von beiden Seiten versteht sich.

Durch die Trümmerwolke eines frisch abgeschossenen Marschflugkörpers / Drohne zu fliegen ist ein Problem entweder des Trainings oder zu hohen Erfolgsdruck auf die Piloten.
Den Befehlshabenden / Verantwortlichen für beides dafür zur Verantwortung zu ziehen ist absolut legitim.