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Am Ende des Gleises links abbiegen. Am Ende der Halle die Rolltreppe nach unten nehmen. Rechts halten und nach dem grünen S-Bahn Schild (weisses S auf grün) Ausschau halten. Dort erneut die Rolltreppe nach unten nehmen. Du landest automatisch auf einem Gleis, von dem im minutentakt S-Bahnen in beide Richtungen fahren. Als normaler Fußgänger benötigt man vom Ende des Fernverkehrgleises bis zum S-Bahnsteig 2 bis 3 Minuten.
Zum Flughafen kannst du die S1 oder die S8 Richtung Flughafen nehmen. Nicht wundern, diese fahren in unterschiedliche Richtungen, da es zwei Routen zum Flughafen gibt. Vom Hauptbahnhof sind diese ungefähr gleich lang. Solltest du die S1 wählen, beachte aber, dass sich die S1 am Bahnhof Neufahrn teilt. Der vordere Zugteil verkehrt nach Freising, der hintere Zugteil zum Flughafen. Beachte hier die Anzeige im Zug.