Wie macht man diese pcr aufgabe 2.0?
Woher weiß man welche Orientierung für welchen primer existiert? Bitte schnelle Antwort Dankeschön morgen ist Klassenarbeit
Hier ist die Abbildung
1 Antwort
Die Orientierung ist dadurch gegeben, dass die Amplifikation nur in 5'-3'-Richtung erfolgen kann, weil die Polymerase für das Anfügen eines neuen Nukleotids immer ein freies 3'-OH benötigt (die OH-Gruppe am 3. C-Atom des Zuckers).
DNA ist ein doppelsträngiges Molekül, gegeben hast du aber nur die Sequenz des einen Strangs sowie dessen Orientierung. Der andere (nicht dargestellte) Strang, also der Matritzenstrang, ist dazu komplementär und gegenläufig.
Durch die Richtung des Primers und die Tatsache, dass die Amplifikation nur von 5' nach 3' erfolgt, kannst du feststellen, an welchen der beiden Stränge der Primer bindet. Da der Primer komplementär zum DNA-Strang ist, an den er bindet, kannst du so dessen Sequenz ablesen.
Außerdem ist in der Aufgabe gefordert, dass du die Sequenz von 5' nach 3' angeben sollst. Die Orientierung ist deshalb auch wichtig, weil sie dir vorgibt, ob du die Sequenz von links nach rechts oder von rechts nach links ablesen musst.
Aber die Orientierung ist doch genau das was ich nicht habe und herausfinden muss
Doch, natürlich. Die Richtung ist angegeben. Beim Strang ist sie mit 5' und 3' angegeben und bei den Primern als Pfeil. Dort, wo die Pfeilspitze endet, ist 3'. Dort, wo der Pfeil beginnt, ist 5'.
Achsooooo okay Dankeschön. Also muss ich einfach die Sequenzen der primer herausfinden?
Genau. Das steht ja auch so in der Aufgabenstellung: "Geben Sie die Sequenzen der verwendeten Primer [...] an."
Du darfst mir gern deine Lösungsvorschläge hinterlassen und ich schau dann mal, ob sie richtig sind, wenn du magst.
sorry hab’s erst jetzt gesehen. Danke für dein Angebot! Leider kam sowas nicht mal dran 🤪🤪🤪🤪🤪
Aber was bringt mir das