Ich würde auf Futtermilben tippen. Die mögen auch feuchtes Klima.
Wie du damit umgehst, hängt davon ab, wie viele es sind. Grundsätzlich können ein paar Futtermilben deinem Hamster nicht schaden. In großer Menge können sie die Qualität des Futters mindern. Wenn es kein massiver Befall ist, reicht es wahrscheinlich wenn du nach nassen Stellen suchst und die bereinigst. Eventuell auch mal das Futterlager leeren.
Wenn es zu viele werden, hilft wohl nur Großputz (alles mit Essigwasser putzen, Holz ausbacken etc.) Das würde ich aber nur machen, wenn es unbedingt nötig ist. Ist ja auch ein enormer Stress für den Hamster.
Kleiner Tipp: Ich packe neues Futter direkt nach dem Kauf (also, wenn es noch verpackt ist) für 48 Stunden in die Kühltruhe um sowas zu vermeiden.