Einfach einwandern und da wohnen kannst du natürlich nicht. Du brauchst ein Visa wenn du da langfristig bleiben willst. Und als Schüler/Auszubildender bekommst du das nicht soweit ich weiß. Wenn du bei einer japanischen Firma eine Ausbildung machst oder an einer japanischen schule unterrichtest oder sowas in die richtung kannst du vielleicht eins von der Botschaft bekommen. Aber in Japan einwandern ist nicht so einfach. Gibt gerade mal ein paar tausend deutsche die dort leben. Japan hat nur 1.2% Ausländeranteil, und das sind fast alles andere Ostasiaten.
Wenn du da dauerhaft bleiben möchtest musst du also schon ordentlich was vorweisen können. Diese Leute die aus Europa kommen sind meist hochqualifizierte Facharbeiter oder einfach deutsch-(englisch-, spanisch-...) Lehrer.