Die Frage ist ganz einfach zu lösen:
In zusammengesetzten Substantiven sind semantisch immer beide Bereiche enthalten. Eine Internetaffäre ist also ganz klar eine Affäre im Internet. Die Antwort ist aber vermutlich so sinnlos wie die Frage.
Die Frage, die Dich sicher mehr interessiert besteht wohl darin, ob es in Ordnung ist, eine solche zu führen und ob es Betrug an der Partnerin oder dem Partner ist.
Auch hier ist die Antwort ganz klar und einfach zu finden: Eine Affäre (ganz gleich ob im Bett, im Schrank, im Internet, mit dem Telefon oder über Rauchzeichen) ist ein Betrug am Partner (geschlechtsneutral). Sicher kann man sich eigene Gedanken machen und sich vorstellen, wie es mit jemandem wäre, den man und so weiter - aber Du stellst es Dir ja nicht nur vor, im Chat geht es sogar schon "heiß her" - die Interaktion mit einem realen Menschen (hinter einem anderen Bildschirm) ist also vollzogen und das in eindeutiger sexueller Absicht.
Die Frage, was ich Dir raten kann, ist ebenso einfach zu beantworten. Entscheide Dich ganz klar für eine Internetbeziehung oder für einen richtigen Partner. Entweder liebst Du Deinen jetzigen Partner mit "Körper und Seele" oder Du magst ihn nur und lebst einfach neben ihm her. Wenn Du ihn liebst, wirf die Internet-Affäre weg, wenn Du ihn nicht liebst, dann trenne Dich von ihm - denn sonst betrügst Du ja deine heiße Internet-Affäre mit Deinem Partner...! [Ganz witzig: Man betrügt den Betrüger...]
Eine weitere Möglichkeit gäbe es auch noch: Suche Dir ein Tier als Partner im Leben und einen Menschen als Sexpartner im Leben. Lies mal bei A. Schopenhauer (dt. Philosoph) nach. Er unterscheidet zwischen Lebenspartnern (Menschen und Tieren) und Sexpartnern (natürlich Menschen). Da Lebenspartner als Menschen wohl kaum glücklich werden würden, wenn Du neben Ihnen ständig Sex (auch virtuellen) mit anderen hast, suche Dir lieber ein Tier als Seelenfreund und eine schöne Frau oder/und einen schönen Mann fürs Bett. Tiere verzeihen dies wohl eher.
Die pessimistische Einstellung Schopenhauers, dass eine Liebe (= Freundschaft + Sicherheit + Vertrauen + Sex + Seelenverwandtschaft...) nicht ein Leben lang halten kann, ist allerdings schon durch den Begriff und Inhalt der Liebe selbst widerlegt; es gäbe den Begriff der "immerwährenden Liebe" gar nicht, wenn es sie nicht geben kann.
Wenn Du Dich also einem heißen Chat hingibst, hintergehst Du bewusst Deinen Partner und machst ihn sicher unglücklich. Mit jedem "Enter" entfernst Du Dich mehr von ihm. Entscheide Dich einfach und sei ehrlich zu Dir selbst und Deinen Mitwesen (Menschen und Tieren).