Lösung:
Ich habe nachdem ich alle anderen Komponenten ausschließen konnte, das Mainboard zu MSI nach Polen zur Reperatur geschickt. Tatsächlich war etwas defekt. Sie schreiben: Swap electrical component wurde repariert. Keine Ahnung was das ist, aber nun ist alles wieder zusammen gebaut und funktioniert nach fast 2 Monaten endlich wieder.