Nein, wirkliche Nachteile hast du nicht, wenn du bei einem Drittanbieter kaufst.
Das gleichzeitige Abonnieren von Apple Care+, welches ich bei den inzwischen ja extrem hohen iPhone Preisen wirklich empfehle, ist bei Apple aber etwas einfacher gestaltet, oder Drittanbieter bieten diese Möglichkeit gar nicht direkt an.
Nur bei Mobilfunkanbietern würde ich niemals ein Handy kaufen.
Manche Mobilfunkanbieter versehen die Gerät immernoch mit sogenannten ,,SIM-Locks", durch die das Handy sich dann nur mit einer SIM-Karte von diesem Anbieter nutzen lässt.
Machen die großen Anbieter zwar nicht mehr, aber ich würde es trotzdem lassen.
Aber später hast du eigentlich keine Nachteile, wenn du nicht direkt bei Apple bestellt hast.
LG