Wird man bestraft wenn man bei gelbe ampel gefahren ist und geblitzt wurde weil andere über rot gefahren sind?

Ein guter Ampelblitzer kann das schon unterscheiden, wer wann gefahren ist.

Theoretisch kann es aber auch bei gelb ein Verwarngeld geben, wenn ein Anhalten noch gefahrlos möglich gewesen wäre.

Nein. Das wäre ja auch dem Beweisfoto von dem Blitzer zu erkennen.