Was ist der Unterschied zwischen Kern und Samen?

Ein Kern sitzt in einem Kerngehäuse (Apfel). Ein Samen kann zum Beispiel in einem Stein sein ( Pflaume, Aprikose) oder einfach in der Frucht sein (Beeren).

Wenn man es nicht so eng sieht ist es nur eine Formulierungssache.

Ich glaube der Samen ist im Kern, aber sicher bin ich mir nicht.

Es gibt keinen Unterschied. Der Kern ist eine feste Umhüllung eines Samens. Es gibt Samen in Kernen, aber auch welche ohne. Die haben dann nur ein schützendes Häutchen.

der Kern könnte zum Samen werden

Der Kern ist der Samen!