Allahu sagt man, wenn auf dem Wort ein weiteres Wort folgt. Das ist in diesem Fall die Steigerung akbar (die sich vom Adjektiv kabir [groß]) ableitet. Allah sagt man, wenn auf dem Wort nichts folgt.

Es geht hier nur um eine unterschiedliche Aussprache. Die Schreibweise im Arabischen unterscheidet sich nicht.