Weil es mit der DNA gar nichts zu tun hat. Jeder Mensch hat die komplette DNA für Penis und Vagina und nur die Hormone bestimmen, was für ein Geschlechtsteil sich herausbildet. Bei Vögeln ist es tatsächlich so, dass das Gen für einen Penis auf einem Chromosom liegt, das nur die Männchen haben. Bei Säugetieren und damit auch bei Menschen ist das anders.
Das, was das Y-Chromosom beim männlichen Körper tut ist den Befehl zu geben, Testosteron zu produzieren, wodurch sich der Körper vermännlicht. Fehlt dieses Testosteron bildet sich eine weibliche Anatomie.
Die grundlegenden Organe, aus denen sich die Geschlechtsteile beider Geschlechter entwickeln sind nämlich gleich. Der Penis entspricht der Klitoris, die Schamlippen dem Hodensack, die Eierstöcke den Hoden usw. Die grundlegenden Organe werden aber zu einer Zeit gebildet, lange bevor der Körper sich auf ein Geschlecht spezialisiert. Dasselbe gilt bei den Nippeln, nur dass hier die körperlichen Unterschiede erst in der Pubertät entstehen.