Nein, das sind keine "Ausnahmen". Bei der Perfektbildung gibt es nur wenige Regelmäßigkeiten; z.B. bilden die Verben auf -are häufig den Perfekt auf -avi, die auf lang -ere (z.B. monere) auf -ui (monui) - bei beiden gibt es aber jede Menge Ausnahmen.
Ist eine wirklich gute Frage, ich kenne leider keine verbindenden Eigenschaften der Verben der verschiedenen Perfektbildungen - also meines Wissens wirst du wohl die Stammformen eher auswendig lernen müssen :-/
Hier hast du einen guten Überblick über die versch. Perfektbildungsklassen:
http://mafl-latein.de/html/stammformenlisten.html