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Mit Premiere Pro geht das wahrscheinlich am besten. Leider ist davon nur die mittlerweile sehr veraltetete Version 2.0 Freeware, aber die neue Version zu kaufen, lohnt sich.
In dem Programm kannst du zwei Videos übereinander einfügen und das eine dann kleiner skalieren und die Position bestimmen.
Gibt dazu sehr viele ausführliche Tutorials.