Probier mal das hier (Neuinstallation, aber Spielstände bleiben erhalten): Gehe in den Ordner "eigenen Dokumente", dort müsste der Ordner "My Games" sein. In diesem klick auf den Skyrim Ordner, dann auf Saves (also "C:\Users[Benutzer]\Documents\My Games\Skyrim\Saves") und kopiere dir alle Dateien darin in einen seperaten Ordner. Jetzt starte die "uninstall.exe" im Skyrim Installationsverzeichnis, also deinstalliere Skyrim. Die Dateien, die jetzt noch im Skyrim Verzeichnis sein müssten, stammen von Mods. Ich würde dir Raten sie einfach alle zu löschen, oder sie zumindest in einem anderen Ordner zu "backup-en". Jetzt installiere Skyrim neu. Danach kannst du alle Dateien, die du im "Saves"-Ordner hattest, dort wieder hineinverschieben. Und Voilà, du hast ein Vanilla Skyrim, mit den alten Spielständen. Wenn du in den alten Spielständen allerdings z.B. eine Waffe von einem Mod hattest, installiere diesen Mod einfach wieder.