Das ist reine Geschmacksache. Es gibt Bücher, bei denen das so gehandhabt wird. Wenn du's also so machen willst, dann tu es. Und auch wenn es "komisch" wäre... Es ist dein Buch, mach es so, wie du willst.

Im Zweifel ist eine Entschuldigung immer besser, als nichts zu sagen. Kehr den Spiess mal um: Jemand entschuldigt sich bei dir, obwohl du keine Entschuldigung von dieser Person erwartet hast.

Würde dich das stören, oder würdest du es als freundlich und aufmerksam empfinden?

Ich für meinen Teil würde mich darüber freuen. Wenn es dir aber wirklich so peinlich erscheint, dann kannst du auch einfach fragen, ob du genervt hast und dich dann der Antwort entsprechend verhalten.

Unter dem Strich ist reden aber immer besser, als schweigen. So wurde schon die ein, oder andere Mücke davor bewahrt, zum Elefanten zu werden.