Grundsätzlich kann ich dir empfehlen, das Handy über die Einstellung die SD-Karte integrieren zu lassen. So wird sie dem Systemspeicher virtuell hinzugefügt und es kommt weniger zu Speicherort-Komplikationen.
Ansonsten wollen Apps sowie Dateien immer lieber auf dem Gerätespeicher sein, weil dieser schneller zugreifbar ist. Das nervt, ist aber verständlich. An deiner Stelle würde ich das Handy an den PC anschließen oder den Datei-Browser in Android öffnen und Dateien rauslöschen, die du nicht mehr brauchst.
Auch Apps wie der CCCleaner haben eine gute Auswirkung, da sie den Cache leeren, sowie renundante Dateien löschen.