Hallo!

So richtig kann ich Dir leider nicht helfen und den Fehler genau fassen. Ich vermute mal, Du hast schon mal kontrolliert, ob der Prozessor richtig rum steckt?

Das blinken der Download-LED wird ja durch den UBS<--> Seriell-Wandler gesteuert. Ich kann mir daher schon vorstellen, dass die blinken, auch wenn der 328 nicht läuft - aber auch wieder neu eine Vermutung, da ich diesen Fall noch nie hatte.

Daher würde ich:
1. Schauen ob er richtig steckt
2. die Versorgungsspannung auf dem uP kontrollieren
3. Kurzgeschlossene Ausgänge kannst Du ausschließen? Vielleicht siehst Du Lötspritzer bei den Ausgangspins?

Ansonsten würde ich den Prozessor tauschen, kostet ja nicht die Welt - oder das ganze Board.

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Schau mal beim Arduino nach Interrupten und dem Timer1 nach.

Den Timer1 kannst Du z.B. auf 5 Sekunden Interrupte parametrieren. Dann zählst Du in der Interruptroutine die Interrupte.

Einmal machst Du da was nach 4 Interrupten, einmal nach 36 Interrupten. 

In der normalen Loop kannst Du dann ganz normale andere Dinge machen lassen. So was über eine Delay zu steuern ist möglich, aber ..........

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Also ganz schlau werde ich aus Deiner Frage nicht, aber:

In der Beschreibung der Library steht wohl nur was zur Nutzung dieser Lib, nichts zu der Installation.

Die Arduino Umgebung muss nicht "installiert" werden, sie kann auch kopiert werden, ist also ein Copy-Deployment.

Also kopiere das alles zum Arduino dort hin wo Du es haben willst, tunlichst auf C:, denn da ist es schneller.

Die Library musst Du dann in das Verzeichnis Arduino\libraries kopieren. Dann die Oberfläche neu starten falls die schon läuft, denn die suchen nach Libs nur beim Programmstart.

Deine Programme kannst Du dann z.B. auf der normalen Festplatte in einem Arbeitsverzeichnis lagern.

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Also ohne Schaltbild ist schwer genau zu beschreiben, was falsch ist.

Aber:
Der Emitter liegt wohl auf GND. Basis ist die Ansteuerung und der Collector geht zu den Dioden/Vorwiderstand. Wenn Du nu aber den Collector trennst, dann sind die LEDs doch sicher aus, ansonsten solltest Du da noch mal die Grundschaltung prüfen.

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