Fasta Parsen

Wisst ihr wie ich fast file parsen kann

1 Antwort

29.07.2024, 21:32

Laut Wikipedia ist es ein recht einfaches textbasiertes Format: https://en.wikipedia.org/wiki/FASTA_format

Du könntest solche als String einlesen und zurecht scheiden. Vielleicht auch einmal durchgehen und in konkrete Typen umwandeln. Das sollte kein Problem darstellen, ist aber natürlich je nach Sprache unterschiedlich.

Ich habe hier Informationen zum Format gefunden: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/doc/blast-topics/ | https://zhanggroup.org/FASTA/

Hier gibt es die FASTA Software: https://fasta.bioch.virginia.edu/fasta_www2/fasta_down.shtml. Quellcode, an welchem du dich orientieren kannst, ist auch vorhanden: https://fasta.bioch.virginia.edu/wrpearson/fasta/

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Hallo, ich bin an einem Sprachassistenten dran und bin gerade bei der "Speech-to-Text" Funktion. Das ist mein bisheriger Code:

import speech_recognition as sr


def aufnahme():
    r = sr.Recognizer()

    with sr.Microphone() as quelle:
        r.pause_threshold = 0.8
        r.adjust_for_ambient_noise(quelle)
        gesagt = r.listen(quelle)

    try:

        q = r.recognize_google(gesagt, language="de")
        print("Recognized speech (Google):", q)
        return q

    except sr.UnknownValueError:
        print('Leider nicht verstanden (Google)')
        print("Recognized speech (Google):", r.recognize_google(gesagt, show_all=True, language="de"))

    except sr.RequestError as e:
        print(f'Fehler bei Sphinx-Erkennung: {e}')
        return "Ich warte auf Anweisungen"


# Call the function
result = aufnahme()
print(result)

Jedoch funktioniert er richtig schlecht, er versteht höchstens zwei Wörter und in 90% der Fälle kommt dieser Fehlercode:

Leider nicht verstanden (Google)

Traceback (most recent call last):

File "C:\Users\...\PycharmProjects\voiceAssistant\main.py", line 21, in aufnahme

q = r.recognize_google(gesagt, language="de")

File "C:\Users\...\lib\site-packages\speech_recognition\recognizers\google.py", line 251, in recognize_legacy

return output_parser.parse(response_text)

File "C:\Users\...\lib\site-packages\speech_recognition\recognizers\google.py", line 124, in parse

actual_result = self.convert_to_result(response_text)

File "C:\Users\....\lib\site-packages\speech_recognition\recognizers\google.py", line 173, in convert_to_result

raise UnknownValueError()

speech_recognition.exceptions.UnknownValueError

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):

File "C:\Users\...\PycharmProjects\voiceAssistant\main.py", line 35, in <module>

result = aufnahme()

File "C:\Users\...\PycharmProjects\voiceAssistant\main.py", line 27, in aufnahme

print("Recognized speech (Google):", r.recognize_google(gesagt, show_all=True, language="de"))

File "C:\Users\...\lib\site-packages\speech_recognition\recognizers\google.py", line 251, in recognize_legacy

return output_parser.parse(response_text)

File "C:\Users\...\lib\site-packages\speech_recognition\recognizers\google.py", line 124, in parse

actual_result = self.convert_to_result(response_text)

File "C:\Users\...\lib\site-packages\speech_recognition\recognizers\google.py", line 173, in convert_to_result

raise UnknownValueError()

speech_recognition.exceptions.UnknownValueError

Process finished with exit code 1

Woran liegt das, soll ich eine andere Speech Recognition verwenden und wenn ja welche?

Vielen Dank im Voraus!

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python script mehrmals innerhalb eines bash shell scriptes ausführen?

Hallo ich will ein python script mehrmals mit einem Parameter innerhalb einer Schleife in einem bash shell Script ausführen. ich erhalte folgenden Fehlercode:

Traceback (most recent call last):

File "Simple_XML_HLSeven_Converter.py", line 19, in <module>

tree = ET.parse(dir_path+'/'+sys.argv[1])

File "/usr/lib/python3.6/xml/etree/ElementTree.py", line 1196, in parse

tree.parse(source, parser)

File "/usr/lib/python3.6/xml/etree/ElementTree.py", line 586, in parse

source = open(source, "rb")

FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: '/opt/test/philips-xml/./test-mdm.mdm\n./test2-mdm.mdm'

das ist mein Quellcode:

#!/bin/bash

list=$(find . -type f -name "*.mdm")

echo "$list"

for var in "$list"

python3 Simple_XML_HLSeven_Converter.py "$var"

done

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Hallo.

Also ich brauche Hilfe. Ich würde gern Windows Forms über Python statt mit C# programmieren, weil Python kann bis unendlich viel rechnen als C# und daraus möchte ich einen super Taschenrechner programmieren.

Ich verwende den Qt Designer und versuche denn Code umzuwandeln. Ich habe im Internet geschaut und diesen Code eingegeben:

from PyQt5 import uic, QtWidgets
import sys
 
class Ui(QtWidgets.QDialog):
    def __init__(self):
        super(Ui, self).__init__()
        uic.loadUi('Test.ui', self)
        self.show()
 
if __name__ == '__main__':
    app = QtWidgets.QApplication(sys.argv)
    window = Ui()
    sys.exit(app.exec_())

Ja und wenn ich das dann ausführe, spuckt er diese Fehlermeldung aus:

Traceback (most recent call last):
  File "C:/Users/PrinzPersia/Documents/Test.py", line 12, in <module>
    window = Ui()
  File "C:/Users/PrinzPersia/Documents/Test.py", line 7, in __init__
    uic.loadUi('Test.ui', self)
  File "C:\Users\PrinzPersia\AppData\Local\Programs\Python\Python35-32\lib\site-packages\PyQt5\uic__init__.py", line 226, in loadUi
    return DynamicUILoader(package).loadUi(uifile, baseinstance, resource_suffix)
  File "C:\Users\PrinzPersia\AppData\Local\Programs\Python\Python35-32\lib\site-packages\PyQt5\uic\Loader\loader.py", line 72, in loadUi
    return self.parse(filename, resource_suffix, basedir)
  File "C:\Users\PrinzPersia\AppData\Local\Programs\Python\Python35-32\lib\site-packages\PyQt5\uic\uiparser.py", line 992, in parse
    document = parse(filename)
  File "C:\Users\PrinzPersia\AppData\Local\Programs\Python\Python35-32\lib\xml\etree\ElementTree.py", line 1183, in parse
    tree.parse(source, parser)
  File "C:\Users\PrinzPersia\AppData\Local\Programs\Python\Python35-32\lib\xml\etree\ElementTree.py", line 583, in parse
    source = open(source, "rb")
FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: 'Test.ui'

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Schreiben:

Lesen:

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Wie fasse ich Programmiersprachen und HTML zu einem Wort zusammen?

Möchte bei meinem Lebenslauf auflisten, welche Programmiersprachen ich kann. Dabei möchte ich jedoch auch HTML und CSS auflisten.

Wisst ihr, wie ich das nennen könnte? Weil wenn ich Programmiersprachen hinschreibe könnte es unprofessionell wirken, weil HTML und CSS sind ja keine.

Sollte dann ca so aussehen:

XXXXsprachen - Java, C, ... , HTML, CSS

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wieso PHP Parse error: syntax error, unexpected token ";" in /home/emmanuel/Downloads/hp.php on line 11?

<link rel="stylesheet" href="style.css">
<?php
$db = unserialize(file_get_contents('data.php'));
if($db == false){
        $db = array();
}
if($_POST['mail'] == ''){
        if($_POST['name'] == ''){
                if($_POST['pass'] == ''){a
                        if(!array_key_exists($_POST['mail'], $db){
                                $db[$_POST['mail']] = [$_POST['name'], []];
                                file_put_contents('data.php', serialize($db));
                        } 
                }
        }
}
?>
<form action="" method="post">
    <center>
        <label for="firma_name" >name:</label><br>
        <input type="text" class="input" name="name" autocomplete="off"><br>
        <label for="produkte">email:</label><br>
        <input type="text"  class="input" name="mail" autocomplete="off"><br>
        <label for="adresse">pass:</label><br>
        <input type="text"  class="input" name="pass" autocomplete="off"><br>
        <input type="submit" class="anmelde_button" value="anmelden">
    </center>
</form>

wieso PHP Parse error: syntax error, unexpected token ";" in /home/emmanuel/Downloads/hp.php on line 11?

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Python Chatbot-Fehler: Wo liegt hier das Problem?

Ich programmiere jetzt seit mehreren Stunden diesen Chatbot und finde den Fehler nicht, warum er es nicht schafft, auf die Frage: gut die richtige Antwort zu geben.

Hier ist mein Code und wenn ihr den Fehler findet, wäre ich euch sehr dankbar.

main.py:

class NeuroSama:
    def __init__(self):
        self.known_topics = self.load_topics("knowledge_base.txt")
        self.conversation_history = []
        self.load_conversation_log("conversation_log.txt")

    def respond(self, message):
        response = ""

        # Hier wird die Eingabe in Kleinbuchstaben umgewandelt, bevor sie verarbeitet wird
        message = message.lower()

        if self.is_new_topic(message):
            response = "Nein, was ist " + message + "?"
        else:
            response = self.get_response_from_file(message, "generate_response.py")

        self.conversation_history.append({"input": message, "output": response})
        return response

    def is_new_topic(self, topic):
        return topic.lower() not in self.known_topics

    def get_response_from_file(self, topic, filename):
        try:
            response_module = __import__(filename.split('.')[0])
            return response_module.generate_response(topic, self.conversation_history)
        except FileNotFoundError:
            return "Die Datei wurde nicht gefunden."
        except AttributeError:
            return "Die Funktion wurde nicht gefunden."

    def save_conversation(self, filename):
        with open(filename, 'w') as file:
            for convo in self.conversation_history:
                file.write(f"Eingabe: {convo['input']}\n")
                file.write(f"Antwort: {convo['output']}\n")
                file.write("\n")

    def load_topics(self, filename):
        known_topics = set()
        try:
            with open(filename, 'r') as file:
                for line in file:
                    known_topics.add(line.strip().lower())
        except FileNotFoundError:
            print("Datei nicht gefunden. Neue Datei wird erstellt.")
            open(filename, 'w').close()
        return known_topics

    def load_conversation_log(self, filename):
        try:
            with open(filename, 'r') as file:
                for line in file:
                    if line.startswith("Eingabe:"):
                        input_text = line[len("Eingabe:"):].strip()
                        output_text = file.readline()[len("Antwort:"):].strip()
                        self.conversation_history.append({"input": input_text, "output": output_text})
        except FileNotFoundError:
            print("Konversationsprotokoll nicht gefunden.")

# Beispielnutzung
neuro_sama = NeuroSama()

while True:
    user_input = input("Du: ")

    if user_input.lower() == 'exit':
        neuro_sama.save_conversation("conversation_log.txt")
        break

    response = neuro_sama.respond(user_input)
    print("Neuro-Sama:", response)

generate_response.py:

def generate_response(topic, conversation_history):
    if len(conversation_history) > 0:
        last_input = conversation_history[-1]['input'].lower()
        if 'hallo' in last_input:
            return "Hallo zurück!"
        elif any(variant in last_input for variant in ['gut', 'gutes', 'gutem', 'guter']):
            return "Es ist großartig zu hören, dass es dir gut geht!"
        else:
            return "Das ist interessant!"
    else:
        return "Ich bin mir nicht sicher, wie ich darauf reagieren soll."

Hier sind die Antworten, die ich derzeit bekommen habe:

= RESTART: C:\Users\####\Desktop\####\main.py
Du: hallo
Neuro-Sama: Hallo zurück!
Du: Hallo
Neuro-Sama: Hallo zurück!
Du: gut
Neuro-Sama: Nein, was ist gut?
Du: 
= RESTART: C:\Users\####\Desktop\####\main.py
Du: gut
Neuro-Sama: Nein, was ist gut?
Du: Gut
Neuro-Sama: Nein, was ist gut?
Du:

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PermissionError: [WinError 5] Zugriff verweigert?

Hi ich weiß nicht wie ich das Problem lösen soll. Ich führe Python als Administrator aus. (Win 7)

Code:

from selenium import webdriver

import time

url = 'https://youtube.com/'

driver = webdriver.Chrome(r'C:\Users\Lars\Downloads\chromedriver_win32')

driver.get(url)

Fehler:

Traceback (most recent call last):

File "C:\Program Files (x86)\Python37-32\lib\site-packages\selenium\webdriver\common\service.py", line 76, in start

stdin=PIPE)

File "C:\Program Files (x86)\Python37-32\lib\subprocess.py", line 775, in __init__

restore_signals, start_new_session)

File "C:\Program Files (x86)\Python37-32\lib\subprocess.py", line 1178, in _execute_child

startupinfo)

PermissionError: [WinError 5] Zugriff verweigert

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):

File "C:\Users\Lars\Desktop\emails.py", line 5, in <module>

driver = webdriver.Chrome(r'C:\Users\Lars\Downloads\chromedriver_win32')

File "C:\Program Files (x86)\Python37-32\lib\site-packages\selenium\webdriver\chrome\webdriver.py", line 73, in __init__

self.service.start()

File "C:\Program Files (x86)\Python37-32\lib\site-packages\selenium\webdriver\common\service.py", line 88, in start

os.path.basename(self.path), self.start_error_message)

selenium.common.exceptions.WebDriverException: Message: 'chromedriver_win32' executable may have wrong permissions. Please see https://sites.google.com/a/chromium.org/chromedriver/home

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TypeError bei Python-Programm?

Ich habe folgendes Programm:

import itertools

# Daten aus der Tabelle einlesen
data = []
with open('tour1.txt', 'r') as file:
    for line in file:
        parts = line.strip().split(',')
        data.append((parts[0], int(parts[1]), parts[2] == 'X'))

# Essentielle Tourpunkte auswählen
essential_points = [place for place, year, is_essential in data if is_essential]

# Funktion zur Berechnung der Teiltour
def calculate_tour(places, essential_places):
    min_distance = float('inf')
    min_tour = None

    for perm in itertools.permutations(essential_places):
        tour = [places[0][0]] + [places[i][0] for i in perm] + [places[0][0]]
        total_distance = 0

        for i in range(len(tour) - 1):
            total_distance += abs([x[1] for x in places if x[0] == tour[i]][0] - [x[1] for x in places if x[0] == tour[i + 1]][0])

        if total_distance < min_distance:
            min_distance = total_distance
            min_tour = tour

    return min_tour

# Sortieren der Orte nach ihrem Jahr
sorted_data = sorted(data, key=lambda x: x[1])

# Die Teiltour berechnen
shortest_tour = calculate_tour(sorted_data, essential_points)

# Ergebnis ausgeben
for point in shortest_tour:
    print(point, end=" -> ")
print(shortest_tour[0])  # Zum Startpunkt zurückkehren

Beim Ausführen wird mir folgender Fehler ausgegeben: TypeError: list indices must be integers or slices, not str

Die Textdatei ist nach dem Format "Brauerei,1613,X,0" (als Beispiel) aufgebaut.
Ich habe probiert das Problem durch ein voranstellen von Int() bei den Listen zu Lösen, was nicht funktioniert hat...
Gibt es eine andere Möglichkeit zur Lösung?

Vielen Dank!

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Linux Mint Menu Fehler (Anwendungen nicht sichbar/Fehlercode)?

Seit einiger Zeit kommt nach dem normalen Anmelden bei Linux Mint (Rosa 17.3) die folgende Fehlermeldung in einem Fenster: Modul konnte nicht initialisiert werden applications : Traceback (most recent call last):

File "/usr/lib/linuxmint/mintMenu/mintMenu.py", line 320, in PopulatePlugins MyPlugin.do_plugin()

File "/usr/lib/linuxmint/mintMenu/plugins/applications.py", line 1326, in do_plugin self.Todos()

File "/usr/lib/linuxmint/mintMenu/plugins/applications.py", line 584, in Todos self.buildButtonList()

File "/usr/lib/linuxmint/mintMenu/plugins/applications.py", line 614, in buildButtonList self.updateBoxes(False)

File "/usr/lib/linuxmint/mintMenu/plugins/applications.py", line 1733, in updateBoxes item["button"] = MenuApplicationLauncher( item["entry"].get_desktop_file_path(), self.iconSize, item["category"], self.showapplicationcomments, highlight=(True and menu_has_changed) )

File "/usr/lib/linuxmint/mintMenu/plugins/easybuttons.py", line 482, in __init__ ApplicationLauncher.__init__( self, desktopFile, iconSize )

File "/usr/lib/linuxmint/mintMenu/plugins/easybuttons.py", line 254, in __init__ desktopItem = xdg.DesktopEntry.DesktopEntry( desktopFile )

File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/xdg/DesktopEntry.py", line 33, in __init__ self.parse(filename)

File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/xdg/DesktopEntry.py", line 42, in parse IniFile.parse(self, file, ["Desktop Entry", "KDE Desktop Entry"])

File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/xdg/IniFile.py", line 81, in parse raise ParsingError("Invalid line: " + line, filename)

ParsingError: ParsingError in file '/usr/share/applications/mate-terminal.desktop', Invalid line:

Außerdem werden im Menü keine Anwendungen oder Favoriten angezeigt. mintmenu --reset und mate-panel --reset zeigen keine positive Wirkung, das Menü-Icon verschwindet entweder ganz und lässt sich auch nicht über die Windows-Taste auf der Tastatur aufrufen oder erscheint nur teilweise und nichts lässt sich darin anklicken. Habe das Internet schon ein bisschen durchstöbert und in englischen Foren einige weitere Lösungsansätze ausprobiert, aber nichts hat geholfen. Wenn jemand ein Ähnliches Problem hatte und es irgendwie gelöst hat oder weiß was zu tun ist, lasst es mich bitte wissen! LG Shade

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