Antwort
Ja, es geht, kein Problem, sogar mit nur einer Datenbank. Du musst nur darauf achten, dass in der Konfigurationsdatei wpconfig die Datenbanken verschiedene Präfixe ('$table_prefix = xxxx') zugewiesen werden.
Ansonsten brauchst du nur in zwei verschiedene Verzeichnisse zu installieren. Die Installationen können dann ggfs. so auch aufgerufen werden über "/verzeichnis1" bzw. "/verzeichnis2". Oder du benutzt einfach Subdomains