Erstmal um Klarheit zu schaffen: InnoDB ist eine Storage-Engine für MySQL. Seit MySQL Version 5.5 ist das die Default Storage Engine. Davor war es MyISAM.

Wenn du beispielsweise eine Tabelle über PhpMyAdmin neu anlegst solltest du die Möglichkeit haben die Storage-Engine irgendwo auszuwählen. Solltest du irgendwo die Möglichkeit haben eine SQL-Query auszuführen, kannst du so beispielsweise eine neue InnoDB-Tabelle erstellen:

CREATE TABLE t (i INT) ENGINE = InnoDB;

und damit eine bestehende ändern:

ALTER TABLE t ENGINE=InnoDB;

Wo das bei dir geht, kann ich dir nicht sagen. Such dir am besten einen Hoster mit MySQL > 5.5.

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Lies ein Buch.

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