Christian Science wird von denjenigen Kirchen als Sekte bezeichnet, die die Regeln aufgestellt haben, was Kirche ist und was christlich ist. Mary Baker Eddy, die Kirche gegründet hat, hat festgestellt, das ihrer Ansicht nach, wesentliche Elemente des Christentums wie Gott, Schöpf, Heilung, Sünde und Strafe, dem Sinn nach nicht richtig dargestelltt werden. In dem Lehrbuch, das von Christlichen Wissenschaftern nie der Bibel übergordnet wird, schreibt sie auf Seite 547 :26 "Die Bibel ist sehr heilig. Es muss unser Ziel sein sie geistig zu verstehen, denn nur durch dieses Verständnis kann die Wahrheit erlangt werden. Die wahre Theorie vom Universum, einschließlich des Menschen, liegt nicht in materieller Geschichte, sondern in geistiger Entwicklung.
Christian Science wird nicht von allen Kirchen als Sekte bezeichnet.