Es gibt österreichische und schweizerische Reedereien deren Handelsschiffe auf den Weltmeeren verkehren. Ob sie unter der jeweiligen Flagge unterwegs sind sagt dir vielleicht wikipedia: http://de.wikipedia.org/wiki/%C3%96sterreichische_Handelsmarine#Hochseeschifffahrt
Schätze aber, das auch die Schiffe dieser Reedereien unter der Flagge von Panama, Liberia, etc. verkehren.