Ich habe jetzt rausgefunden, dass, um die Zeichenfunktion der Notizen App auch bei Notizen in der iCloud nutzen zu können, mindestens 2 Geräte, die in der Cloud angemeldet sind, unter iOS 9 laufen müssen. Habe gelesen, dass es auch gehen soll, wenn ein Mac auf dem OS 10.11 installiert ist, in der Cloud angemeldet ist. 

Bei der Notizen-App gibt es einmal die Notizen, die in der iCloud gespeichert werden und die Notizen, die auf dem iPhone sind. Die Zeichenfunktion funktioniert nur bei den Notizen, die auf dem iPhone gespeichert sind. Also - Notiz-App starten - oben links auf dem Pfeil klicken und mal schauen, welcher Account aktiviert ist. Dann einfach mal die Notizen "auf meinem iPhone" anwählen und dann sollte es auch mit der neuen Zeichnen-Funktion klappen.