Für viele Kinder ist es verstörend, wenn sie ihre Eltern/ ein Elternteil beim Sex "erwischen" bzw. soviel mitbekommen, dass man es nicht mehr (wie wohl sonst die meiste Zeit) verdrängen kann, dass sie es auch tuen. 

Zwar ist es ganz normal und gut, dass auch Eltern Sex haben, und doch erstmal komisch.

Ich würde erst mal davon ausgehen, dass du fähig sein wirst, dich an den Gedanken zu gewöhnen, auch wenn sich das erstmal nicht so anfühlen mag. 

Wenn du nach ein paar Tagen deiner Mutter immer noch nicht wieder in die Augen schauen kannst, würde ich an deiner Stelle versuchen das Gespräch mit deiner Mutter zu suchen. Dabei solltest du versuchen weder wertend noch vorwurfsvoll zu klingen, denn es ist vollkommen okay was deine Mutter macht. Du kannst ihr z.B. sagen, dass du letztens mitbekommen hast, dass sie mit ihrem guten Freund geschlafen hat, und dass es für dich unangenehm ist und du aktuell Probleme hast, damit umzugehen. Sicher ist es für deine Mutter auch unangenehm, dass du es mitbekommen hast. Wirf ihr nicht vor, dass sie es doch hätte machen können als du nicht da warst, denn auch du wirst im Leben wahrscheinlich noch in Situationen kommen, wo es "hier und jetzt" sein muss ;-) Ich-Botschaften, wie "Ich mache mir Sorgen, da er eine Familie hat" sind angebrachter als "hast du mal an seine Frau und Kinder gedacht?!"

Ich hoffe ich konnte dir helfen! Viel Erfolg bei dem Gespräch, falls du vorhast es zu führen :)