Zunächst:

Midi überträgt nur digitale Daten, die Tastenanschläge usw. also ein Signal wenn eine Taste gedrückt wird. Es wird kein Ton übertragen, dieser wird erst an dem Endgerät durch die Software generiert. So lassen sich digitale virtuelle Instrumente am PC bedienen.

S\PDIF Lichtleiter übertragen dagegen digitale Audiosignale. Meist gibt es daneben auch den analogen Chinch oder Klinke-Ausgang. Hier wird der Sound vom Instrument generiert und übertragen. Um Tom aufzunehmen muss dieser von der Soundkarte abgegriffen werden.

Leider kenne ich die genannte Software nicht.

Für eine einfache Aufnahme des Tons gibt es jedoch etliche Software im Netz. Man muss nur beachten den korrekten Eingang als Aufnahmequelle in den Soundkarten- bzw Windowseinstellungen ausgewählt zu haben.