Beide Ansätze haben ihre Berechtigung. Ich persönlich mache sie immer als erste Übung, weil ich dann noch die volle Kraft habe. Allgemein ist es eine tolle Übung, mit der man wirklich viele Muskeln gut erreichen kann. Ein Kollege von mir macht sie aber immer gegen Ende, weil es "einfach nicht seine Übung ist", und er da ohnehin nicht soviel Gewicht nehmen kann, ohne dass es unangenehm wird. Dann powert er sich damit nochmal richtig aus, und kann mit den geringeren Gewicht sich nochmal richtig tot machen.
Richtig oder falsch gibts da nicht, du musst das einfach für dich selbst ausprobieren, und variieren, um regelmäßig neue Reize zu setzen.
Für mich sind Kniebeugen eine wirkliche Hassliebe, unfassbar anstrengend und ich "genieße" es wirklich nicht, aber mag aufgrund der Effiziens auch nicht auf diese Übung verzichten.