Naja. Wenns nur ein Minecraft Server ist, dann ist es ein wenig Overkill sich nen Server zuzulegen. Aber wenn's Mal mehr wird das gleichzeitig läuft wird's interessant.
Vom CPU Upgrade mit samt Mainboard und RAM würde ich abraten, weils einfach zu teuer ist für das was du dann bekommst.
Wenn du den Server upgraden willst würd ich dir im ersten Schritt einen gebrauchten i7 empfehlen der in den gleichen Sockel passt. Sprich 4770, 4780, 4790. Bzw. Die k Versionen davon. Die sollte man um die 50€ bekommen oft sogar weniger. Dann hast du eine etwas höhere singecore Leistung und 4 Threads mehr.
Bei Minecraft Servern hat sich meiner Erfahrung nach auch immer ausgezahlt wenn man einfach Sachen vermeidet die den Server zu stark auslasten. z.b. riesige mobfarmen, chuckweise fließendes Wasser, Unmengen an items die am Boden liegen und (aus irgendeinem Grund) nicht despawnen, etc. sowas halt vermeiden