Doch, auch wenn du auf dem Dach springst, würdest du ohne den Fahrtwind einzuberechnen wieder auf der gleichen Stelle auf dem Zug landen. Da auf einem Zugdach jedoch ein starker Wind deine Bewegung im Flug (relativ zum Zugdach) beeinflusst, würdest du hier, anders, als im windstillen Wagen, an einer anderen Stelle landen. Du wirst während der Flugphase quasi nur ein bisschen weggepustet.
Wenn man sich die Situation vorstellt, muss man gegen den Instinkt ein wenig gegenhalten, weil man intuitiv so denkt, wie du es in der Frage beschreibst.
Aber stell dir einen Cabrio-Zug vor. Wenn du nur ein wenig springst, landest du auf derselben Stelle. Springst du nun aber so hoch, dass du in den Fahrtwind gerätst, wirst du weiter nach hinten gedrückt. Das einzige, was sich aus physikalischer Sicht ändert, ist die Wind-Komponente. Ansonsten sind Dach und Boden des Zuges physikal als gleichwertig zu sehen. Hoffe das hilft dir!