Hatte genau das gleiche Problem.
ich konnte es lösen in dem ich nicht über das Game in den eShop ging.
würde folgendes probieren: BOTW beenden, eShop aus dem Konsolen-Menu starten, nach dem DLC suchen, dann steht auch dass es bereits erworben wurde, dann die einzelnen DLC anklicken und erneut herunterladen.
danach BOTW wieder starten und Tadaaa bei mir war alles wieder da
ich hoffe das hilft