Weil die Walnüsse die Kerne der Walnussfrucht sind und man diese Kerne Steine nennt.

Darf aber mal kurz Wikipedia zitieren:

"Die Kerne der Früchte, die ihre Reife durch eine braun und rissig werdende Schale anzeigen, sind als Walnüsse bekannt und überall im Handel erhältlich. Traditionell galten die Früchte der Walnussgewächse in der Botanik als Steinfrüchte. Neuere Untersuchungen zeigen jedoch, dass sie zu den Nussfrüchten zu zählen sind.[1]"