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SSRIs wirken bei Zwangsstörungen, weil sie das serotonerge System in unserem Gehirn beeinflussen: Auf biologischer Ebene erhöhen SSRIs den Serotoninspiegel im synaptischen Spalt, indem sie die Wiederaufnahme von Serotonin in präsynaptische Neuronen verhindern. Mehr Serotonin zwischen den Neuronen bedeutet, dass die serotonerge Transmission erhöht wird.
Wenn ein Ungleichgewicht oder ein Mangel an Regulierung im serotonergen System vorliegt, wird angenommen, dass dieser Zustand zum Ausbruch von Zwangsstörungen beiträgt. Die Erhöhung des Serotoninspiegels im synaptischen Spalt könnte die Optimierung serotonerger Bahnen und ihrer spezifischen Rezeptoren erleichtern; insbesondere lokalisiert in Gehirnzonen wie dem orbitofrontalen Kortex und den Basalganglien, die für die emotionale Kontrolle und Verhaltenskoordination verantwortlich sind.